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医疗 / 生物 训练

某生物医药独角兽

蛋白质结构预测与分子生成模型训练,需要高稳定性和海量存储

3.1x
收敛提速
47%
单卡成本降低
99.9%
可用性

项目概况

集群规模 A100 × 256
技术栈 Colossal-AI + Megatron
运行时长 服务 14 个月
关键亮点 TB 级分子数据 + 高可用保障

关键指标

项目核心数据全景

收敛提速
3.1x
+210%
单卡成本
-47%
-47%
可用性
99.9%
分子数据
TB级
持续服务
14月
故障恢复
<5min
客户证言

客户证言

生物医药训练要跑几周不能断,断了就白费。ZaiCloud 的 checkpoint 自动保存和高可用方案让 14 个月里我们没丢过任何一轮训练,故障 5 分钟内自动恢复,这是过去自建集群做不到的。
王启明
计算化学负责人 · 某生物医药独角兽
14 个月无丢失 5 分钟故障恢复 TB 级数据吞吐

技术架构

从应用到基础设施的四层方案

L4
应用层
AlphaFold 分子生成模型 Colossal-AI
蛋白质结构预测 + 分子生成,模型规模千亿参数级
L3
调度层
分布式 checkpoint Megatron 张量并行 自动恢复
定期 checkpoint + 故障自动恢复,长时训练零丢失
L2
算力层
A100 × 256 NVLink 全互联
256 张 A100 组成高密度训练集群,NVLink 全互联
L1
基础设施层
TB 级分布式存储 高吞吐 I/O 7×24 监控告警
TB 级分子数据存储 + 高并发读写 + 主动告警
顶层为应用层,底层为基础设施层

挑战

项目要解决的核心难题

生物医药模型的训练任务通常持续数周,中途中断会导致全部训练成果损失。同时需要处理 TB 级别的分子数据存储,高并发读写时存储带宽成为瓶颈。

解决方案

ZaiCloud 的核心策略

  1. 1

    ZaiCloud 提供了高可用保障方案:

  2. 2

    Checkpoint 定期保存 + 故障自动恢复;

  3. 3

    分布式存储系统提供 TB 级容量和高吞吐;

实施过程

从集群规划到正式生产的关键里程碑

  1. Week 1-2

    存储系统部署与调优

  2. Week 3-4

    高可用方案配置

  3. Month 2

    首轮训练完成

  4. Month 3+

    持续运行与优化

业务影响

模型收敛速度提升 3.1 倍,14 个月连续训练零丢失

收敛加速

分布式策略与混合精度优化,收敛速度提升 3.1 倍

3.1x

成本下降

智能调度 + 资源复用,单卡日均成本下降 47%

-47%

稳定保障

Checkpoint 机制 + 故障自动恢复,长时训练零丢失

99.9%

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